언론사 조사결과를 발표하고 있는 공정위 이한억 조사국장.

공정거래위원회가 13개 중앙 언론사에 대해 모두 242억원의 과징금을 부과했다. 이 같은 과징금 규모는 공정위가 2000년 7개 재벌그룹에 부과한 전체 과징금 규모(173억원)보다 훨씬 많은 것이었다. 이남기 공정거래위원장은 2001년 6월 21일 10개 중앙 일간지와 3개 방송사를 상대로 부당내부거래를 조사한 결과 총 510억원의 부당지원 사실이 밝혀져 242억원(신문사 203억원, 방송사 39억원)의 과징금을 물렸다고 발표했다.

언론사별로는 조선일보 33억9000만원, 동아일보 62억원, 문화일보 29억원 등 그동안 비판적 논조를 유지해온 신문들이 과징금을 상대적으로 많이 부과받았다. 그러나 한겨레신문(1500만원), 대한매일신보(1억4000만원), 세계일보(3600만원)는 상대적으로 과징금 액수가 미미했다. 방송국도 신문사에 비해 과징금 규모가 상대적으로 적었다. 방송사 가운데는 SBS가 15억원의 과징금을 부과받았고, MBC와 KBS에는 각각 13억원과 11억원의 과징금이 부과됐다.

그러나 공정위가 지금까지 30대그룹과 거대 공기업을 빼고 부당내부거래를 직권 조사한 적이 한번도 없었고, 조사방식도 유례없이 강도가 높았으며, 과징규모도 상식을 뛰어넘는 편파적인 금액이 부과됐다는 점에서 공정위 조사를 비판하는 여론이 높았다. 더구나 신문산업의 특수성과 각 언론사의 소명자료를 전혀 반영하지 않아 언론사로부터 편파적인 조사라는 반발을 샀다.